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中国花生基因组计划


  中国花生基因组计划自启动以来备受国内研究人员及各大媒体的高度关注,67山东电视台、济宁电视台、生物无忧等多家媒体于广东省农业科学院对该项目进行采访。广东省农业科学院作物研究所梁炫强研究员及陈小平博士、山东省农业科学院花生研究所所长禹山林研究员、千年基因项目总监于越、山东圣丰种业科技有限公司科研总监李洪杰等相关人员参加了此次采访,并从花生基因组测序的意义、项目开展方案及最新进展等方面回答了媒体的提问。

  此次采访中,陈小平博士和李洪杰总监分别从科学研究和花生种植的角度介绍了花生基因组测序的意义。植物全基因组测序是挖掘功能基因的最有效的途径,自人类全基因组测序计划完成后,目前全球已有几十种植物完成全基因组测序工作,花生全基因组测序将对花生重要基因的图位克隆、进化研究及分子育种产生重要的意义。同时,作为农业大国,我国拥有大量重要的农作物资源,但农作物本身没有专利权,只有“基因”才受国际专利的保护。虽然我国科学家已培育出诸多优良的作物品种,但大部分并未受到专利保护。花生基因组图谱绘制完成后将使我国在全球范围的花生种植中拥有足够的话语权,并有利于我们培育出更多具有优良性状的新品种,这将对我国花生的种植及产量提升等具有重要意义。    

  千年基因向媒体介绍了该项目的开展方案及最新进展。花生基因组测序以Roche 454454+测序平台为主,结合HiSeq 2000等多种平台进行。千年基因丰富的项目经验使454+平台的优势得到最佳体现,平均读长大于700bp,最高读长高达1.1kb(大于Roche官方提供的1000bp)。一般情况下,重复度超过50%即为基因组比较复杂的物种,而花生A基因组的重复序列比例高达70%,这对后期基因组组装提出了巨大的挑战。结果证明454+的长读长能够很好地跨越重复区域,从而显著改善基因组拼接效果。同时,基于17年的科研经验和多个国际重大基因组项目的执行经验,实验和信息分析团队通过不断地调整方案获得了最优的组装结果。

  最后,中国花生基因组计划的发起单位均表示,今后将针对现有的优质品种开展大规模的重测序研究和转录组测序研究,并结合性状调查的结果进行全基因组关联分析研究。并期望以最快速度将研究成果应用于花生育种等实际工作中,从而花生种植业的发展。

  本次媒体采访的新闻视频将于近期在山东电视台、济宁电视台、生物无忧等媒体播放,届时欢迎大家关注!(文章来源:坚果炒货网)

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